La oficina de Chen fue cateada por las autoridades el 25 de septiembre de 2008 después de que perdiera la elección para el liderazgo de la isla ante el presidente del Partido Kuomintang de China (KMT), Ma Ying-jeou.

Aunque la mayoría de los 1.300 documentos clasificados descubiertos durante el cateo debieron haber sido entregados a la oficina de Ma después de su toma de posesión como líder de Taiwan, Chen los conservó.

Los fiscales ordenaron entonces una segunda inspección de la oficina de Chen en 2010, cuando descubrieron otros 688 documentos clasificados. Los investigadores acusaron a Chen en mayo de 2012 de poseer ilegalmente documentos clasificados.

El tribunal determinó que el juicio no estará abierto al público debido a lo delicado del asunto.